C.elegans et étude computationnelle de maladies orphelines (programme de recherche)

Description du projet

Une approche computationnelle-expérimentale pour accélérer l’étude des interactions protéines-protéines impliquées dans les maladies orphelines

Des mutations au niveau de gènes codant pour des protéines peuvent causer des maladies en affectant la manière dont les protéines se lient à leurs interacteurs. Pour de nombreuses maladies orphelines, cependant, les partenaires d’interaction de ces protéines sont inconnus et l’identification expérimentale d’interactions protéines-protéines est un processus lent, laborieux, et souvent techniquement difficile. Ceci représente un obstacle majeur à l’élucidation des mécanismes pathogènes et limite notre capacité à générer des stratégies thérapeutiques. Notre hypothèse est que la combinaison de prédictions in silico d’interactions protéines-protéines avec une validation expérimentale in vivo utilisant des mutants de C. elegans accélérera considérablement l’élucidation de nouveaux mécanismes moléculaires impliqués dans les maladies orphelines. Notre objectif est ainsi d’élaborer un pipeline intégré computationnel-expérimental pour la découverte et la validation rapide d’interactions protéines-protéines pertinentes pour les maladies rares, en combinant des analyses computationnelles, génétiques, biochimiques et protéomiques. Comme preuve de principe, nous nous concentrerons sur SAX-7/L1CAM, une protéine d’adhésion hautement conservée dont l’orthologue humain est muté dans le syndrome CRASH, une maladie neurodéveloppementale rare. Dans l’ensemble, ce projet a le potentiel d’élargir et d’accélérer l’analyse des réseaux d’interaction impliqués dans les maladies orphelines, d’améliorer les prédictions de pathogénicité, et de contribuer à l’émergence de stratégies thérapeutiques ciblées.