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Des professionnel-les à votre écoute

Consultation et développement de projets

Nous offrons un service de consultation et de développement de projet personnalisé
Veuillez nous contacter pour plus d’informations.

Abdoulaye Baniré Diallo, PhD
Directeur

Farzaneh Rahmdani, MSc
Responsable

Analyses multiples des données NGS

La plateforme de bio-informatique vous offre l’analyse de vos données de NGS (Next-Generation Sequencing) en fonction de vos besoins. De façon non exhaustive, il est possible d’analyser le séquençage d’ADN, d’ARN, des profils de méthylations, de la métagénomiques, etc…

DNA-Seq WES/WGS

Transcriptomique RNA-seq, small RNA-seq

  • Variant calling
  • Assemblage de novo
  • Analyse d’expression différentielle
  • Analyse d’épissage alternatif
  • Identification ncRNA/sRNA
  • Assemblage de transcriptome
  • Détection de réseaux de co-expression
  • Détection de variation de nucléotide unique SNP
  • Identification de marqueur

Métagénomiques et métabarcoding

Methyl-Seq

ATAC-Seq

  • Identification de l’abondance relative
  • Profilage taxonomique
  • Identification des régions de méthylation
  • Analyse de méthylation différentielle
  • Peak-calling

Données Single cell RNA-seq

Vos données peuvent être acquises via notre service clé en main d’analyse de cellules individuelles, de la préparation de la bibliothèque avec les technologies génomiques 10X au séquençage. Contactez-nous ou visitez notre page de plateforme génomique pour plus de détails. Que ce soit via notre plateforme génomique ou en fournissant vos propres données brutes, nous pouvons vous accompagner dans l’analyse de :

  • Identifier des sous-populations de cellules au sein d’un échantillon
  • Identification des gènes différentiellement exprimés par cluster

Autres services

  • Visualisation de données

Vous avez des besoins particuliers? N’hésitez pas à nous contacter pour en discuter.

Analyses fonctionnelles

  • Enrichissement ontologie de gène (GO)
  • Enrichissement des voies métaboliques (KEGG)
  • Identification des interactions protéine-protéine

Formation personnalisée Individuelle ou en groupe

  • Analyse des données NGS
  • Utilisation des ressources de l’Alliance de recherche numérique du Canada (Alliance/Calcul Canada)
  • Gestion des tâches de calcul haute performance
  • Cours d’initiation aux langages de programmation (Bash, R)

 

  • Formation à la demande

Recommandations

Nous avons été très satisfait du travail réalisé par Golrokh. Elle est vraiment professionnelle, compétente et surtout très amicale !! La qualité et le délai du travail sont très satisfaisants!!

Une plateforme gérée à la perfection. Golrokh comprend rapidement nos besoins et nous aide de l’étape de la conception des expériences à leurs analyses. Elle a un don pour vulgariser les éléments très techniques. Toutes nos analyses de bio-informatiques passent entre ses mains.

Tarifs

Les membres du CERMO-FC et les chercheur.es du réseau UQ sont invités à nous contacter pour connaître les tarifs privilèges grâce au support du CERMO-FC.

Tarif de service de bio-informatique à 95$/heure.

Tarif de service de bio-informatique à 150$/heure.

Des frais administratifs de 15% peuvent être applicables.

FAQ - Foire aux questions

Remplissez le formulaire de « Demande de service » en haut de cette page ou contactez-nous.

Contactez-nous pour obtenir une consultation gratuite. Nous évaluerons ensemble comment atteindre vos objectifs, et nous vous indiquerons par la suite les démarches à faire pour débuter votre projet.

Le temps d’analyse de vos données dépend des calculs à faire en fonction de vos besoins. L’ordre des demandes de service repose sur la date de réception des données.

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