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Des professionnel-les à votre écoute

Consultation et développement de projets

Nous offrons un service de consultation et de développement de projet personnalisé
Veuillez nous contacter pour plus d’informations.

Abdoulaye Baniré Diallo, PhD
Directeur

Farzaneh Rahmdani, MSc
Responsable

Analyses multiples des données NGS

La plateforme de bio-informatique vous offre l’analyse de vos données de NGS (Next-Generation Sequencing) en fonction de vos besoins. De façon non exhaustive, il est possible d’analyser le séquençage d’ADN, d’ARN, des profils de méthylations, de la métagénomiques, etc…

Analyse des données DNA-Seq (Whole Exome/Genome Sequencing)

  • Variant calling
  • Cartographie des régions régulatrices
  • Assemblage de novo

Analyse des données RNA-Seq (RNA-seq, sRNA, microarray )

  • Quantification d’expression
  • Analyse d’expression différentielle
  • Analyse d’épissage alternatif
  • Identification ncRNA/sRNA
  • Assemblage de transcriptome
  • Détection de réseaux de co-expression
  • Détection de variation de nucléotide unique dans le transcriptome
  • Détection de fusion des gènes

Analyses métagénomiques

  • Étudier la diversité microbienne
  • Identifier l’abondance relative

Analyse des données de Methyl-Seq

  • Identification des régions de méthylation
  • Analyse de méthylation différentielle

Autres analyses de données

Vous avez des besoins particuliers?
N’hésitez pas à nous contacter pour en discuter.

Analyses fonctionnelles

  • Enrichissement ontologie de gène (GO)
  • Enrichissement des processus biologiques
  • Identification des interactions protéine-protéine
  • Identification des voies métaboliques

Formation personnalisée en traitement et analyse des données

  • Analyse des données NGS
  • Utilisation des ressources de Calcul Canada
  • Ligne de commande Linux
  • Programmation (Python, R, Perl, Java, Bash)
  • Gestion des tâches de calcul haute performance
    • Slurm sur les grappes de Calcul Canada
    • Torque
  • Formations sur demande

Recommandations

Nous avons été très satisfait du travail réalisé par Golrokh. Elle est vraiment professionnelle, compétente et surtout très amicale !! La qualité et le délai du travail sont très satisfaisants!!

Une plateforme gérée à la perfection. Golrokh comprend rapidement nos besoins et nous aide de l’étape de la conception des expériences à leurs analyses. Elle a un don pour vulgariser les éléments très techniques. Toutes nos analyses de bio-informatiques passent entre ses mains.

Tarifs

Les membres du CERMO-FC et les chercheur.es de l’UQAM sont invités à nous contacter pour connaître les tarifs privilèges grâce au support du CERMO-FC.

Tarif de service de bio-informatique à 95$/heure.

Tarif de service de bio-informatique à 150$/heure.

Des frais administratifs de 15% peuvent être applicables.

FAQ - Foire aux questions

Remplissez le formulaire de « Demande de service » en haut de cette page ou contactez-nous.

Contactez-nous pour obtenir une consultation gratuite. Nous évaluerons ensemble comment atteindre vos objectifs, et nous vous indiquerons par la suite les démarches à faire pour débuter votre projet.

Le temps d’analyse de vos données dépend des calculs à faire en fonction de vos besoins. L’ordre des demandes de service repose sur la date de réception des données.

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