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Services 

  • Analyse des données d’ADN-Seq (Whole Exome/Genome Sequencing)
  • Analyse des données d’ARN-Seq (RNA-seq et sRNA)
  • Analyse Métagénomique de matériel génétique issus d’échantillons environnementaux
  • Support des utilisateurs
  • Visualisation des données et résultats
  • Analyses fonctionnelles
  • Interprétation des résultats d’analyses

Analyse des données d’ADN-Seq (Whole Exome/Genome Sequencing)

  • Identification de SNV dans le génome complet
  • Identification des variantes structurelles
  • Cartographie des régions régulatrices
  • Assemblage de novo
  • Capture les régions codantes

Analyse des données d’ARN-Seq (RNA-seq et sRNA)

  • Quantification d’expression et expression différentielle
  • Analyse d’épissage alternatif
  • Identification ncRNA/sRNA
  • Analyse d’assemblage de transcriptome
    • de novo
    • guidé par génome de référence
  • Détection de réseaux de co-expression
  • Détection de variation de nucléotide unique dans le transcriptome
  • Détection de fusion des gènes

Analyse Métagénomique de matériel génétique issus d’échantillons environnementaux

  • Étudier la diversité microbienne.
  • Identifier l’abondance relative de chaque microbe dans un échantillon donné.
  • Pré-filtrage des séquences : suppression de séquences redondantes de faible qualité et de séquences d’origine eucaryote probable
  • Identification et quantification des gènes (homologie ou ab initio)

Support des utilisateurs

  • Consultation spécialisée pour la conception de plan du projet
  • Formation d’utilisation des plateformes web d’analyse de données.
  • Développement de logiciels sur mesure

Analyses fonctionnelles

  • Enrichissement ontologie de gène (GO)
  • Enrichissement des processus biologiques
  • Identification des interactions protéine-protéine
  • Identification des voies métaboliques

Tarifs

Des frais administratifs de 15% sont à prévoir en suppléments.

Tarifs préférentiels pour les chercheur.es du secteur académique.

Les membres du CERMO-FC et les chercheur.es à l’UQAM sont invités à nous contacter pour connaître les tarifs privilèges grâce au support du CERMO-FC.

Pour obtenir une soumission, contactez-nous.