Plateforme de bio-informatique

La plateforme bioinformatique accompagne les principales analyses de données issues du séquençage de haut de débits. Les services proposés couvrent un large éventail de services.

Demande d’informations

Services :

  • Analyse des données d’ADN-Seq (Whole Exome/Genome Sequencing)
  • Analyse des données d’ARN-Seq (RNA-seq et sRNA)
  • Analyse Métagénomique de matériel génétique issus d’échantillons environnementaux
  • Support des utilisateurs
  • Visualisation des données et résultats
  • Analyses fonctionnelles
  • Interprétation des résultats d’analyses

 

Analyse des données d’ADN-Seq (Whole Exome/Genome Sequencing)

  • Identification de SNV dans le génome complet
  • Identification des variantes structurelles
  • Cartographie des régions régulatrices
  • Assemblage de novo
  • Capture les régions codantes

Analyse des données d’ARN-Seq (RNA-seq et sRNA)

  • Quantification d’expression et expression différentielle
  • Analyse d’épissage alternatif
  • Identification ncRNA/sRNA
  • Analyse d’assemblage de transcriptome
    • de novo
    • guidé par génome de référence
  • Détection de réseaux de co-expression
  • Détection de variation de nucléotide unique dans le transcriptome
  • Détection de fusion des gènes

Analyse Métagénomique de matériel génétique issus d’échantillons environnementaux

  • Étudier la diversité microbienne.
  • Identifier l’abondance relative de chaque microbe dans un échantillon donné.
  • Pré-filtrage des séquences : suppression de séquences redondantes de faible qualité et de séquences d’origine eucaryote probable
  • Identification et quantification des gènes (homologie ou ab initio)

Support des utilisateurs

  • Consultation spécialisée pour la conception de plan du projet
  • Formation d’utilisation des plateformes web d’analyse de données.
  • Développement de logiciels sur mesure

Analyses fonctionnelles

  • Enrichissement ontologie de gène (GO)
  • Enrichissement des processus biologiques
  • Identification des interactions protéine-protéine
  • Identification des voies métaboliques

Tarifs :

 Tarifs
Analyses bio-informatique150$/h

Des frais administratifs de 15% sont à prévoir en suppléments

Tarifs préférentiels pour les chercheur.es du secteur académique.

 Tarifs
Analyses bio-informatique95$/h

Les chercheur.es du réseau des Universités du Québec et les membres du CERMO-FC sont invités à nous contacter pour connaître les tarifs privilèges grâce au support du CERMO-FC

Pour obtenir une soumission, contactez-nous